Nếu mẹ bị suy giáp trong thời gian mang thai không được điều trị, thai nhi có nhiều nguy cơ: Tỷ lệ sảy thai, lưu thai tăng gấp đôi. Tỷ lệ chết chu sinh xấp xỉ 20%. Nếu suy giáp do nguyên nhân tự miễn, các kháng thể tự miễn dịch sẽ qua rau thai và có thể gây suy giáp thoáng qua ở thai nhi và trẻ sơ sinh.